1: Cơ cấu tổ chức
1.1. Hội đồng thành viên
1.2. Ban Lãnh đạo: gồm Viện trưởng và các Phó Viện trưởng
1.3. Văn phòng
1.4. Các phòng chuyên môn:
- Phòng tư vấn nghiên cứu môi trường
- Phòng truyền thông, phát triển cộng đồng
- Phòng hợp tác quốc tế
- Phòng công nghệ xử lý môi trường
- Phòng đào tạo, huấn luyện an toàn lao động
- Phòng hành chính kế toán
- Phòng kiểm định, hiệu chuẩn thiết bị
- Phòng tư vấn giáo dục môi trường
1.5. Các chi nhánh, văn phòng đại diện khu vực miền Bắc, miền Trung, miền Nam.
2. Hội đồng thành viên và tiêu chí Chủ tịch hội đồng thành viên:
Sau khi viện thành lập, Hội đồng sáng lập chuyển thành Hội đồng thành viên. Hội đồng thành viên quyết định những công việc quan trọng của Viện như đề nghị sửa đổi điều lệ, đề nghị thay đổi lãnh đạo Viện, quyết định triển khai các hoạt động có giá trị từ 50% vốn điều lệ của Viện. Phương thức ra quyết định của Hội đồng thành viên là bỏ phiếu, quyết định được thông qua nếu có quá 50% số phiếu ủng hộ. Các quyết định tại cuộc họp của Hội đồng thành viên chỉ có hiệu lực khi có trên 50% số thành viên có mặt. Hội đồng thành viên bầu ra chủ tịch hội đồng thành viên. Theo Tiêu chí bầu chọn, chủ tịch hội đồng thành viên phải là người có số vốn góp cao nhất trong hội đồng sáng lập viện và có trình độ tối thiểu là thạc sỹ và là thành viên tham gia sáng lập viện.
2.1. Nhiệm vụ của Chủ tịch hội đồng thành viên Viện:
Phê duyệt mô hình tổ chức nhân sự của viện.
Phê duyệt mô hình bộ máy hoạt động, chiến lược, kế hoạch phát triển của viện.
Đề xuất lên Trung ương Hội ra quyết định bổ nhiệm, miễn nhiệm, các chức danh viện trưởng, phó viện trưởng.
Ký quyết định bổ nhiệm kế toán trưởng của Viện.
Phê duyệt nhân sự bộ máy tổ chức phòng, ban, trung tâm và các phân viện trực thuộc khi lãnh đạo viện đệ trình.
2.2. Ban Lãnh đạo
2.2.1. Viện trưởng
Do chủ tịch Hội Bảo vệ Thiên nhiên và Môi trường Việt Nam bổ nhiệm, miễn nhiệm trên cơ sở đề nghị của Chủ tịch hội đồng thành viên ký.
Quyền hạn và trách nhiệm:
- Là người chịu trách nhiệm trước pháp luật, trước Hội đồng sáng lập Viện cụ thể là trước chủ tịch hội đồng sáng lập Viện và Chủ tịch Hội Bảo vệ Thiên nhiên và Môi trường Việt Nam về mọi tổ chức và hoạt động của Viện;
- Chịu trách nhiệm xây dựng Viện thành một tổ chức vững mạnh, tạo lập uy tín trong nước và quốc tế;
- Là người đại diện của Viện trong các mối quan hệ đối nội và đối ngoại;
- Là người đại diện của Viện ký kết các hợp đồng dịch vụ khoa học và công nghệ;
- Tổ chức triển khai thực hiện các chương trình kế hoạch của Viện;
- Có quyền đề nghị tuyển chọn, bổ nhiệm, miễn nhiệm, bãi nhiệm kế toán trưởng và lãnh đạo các phòng ban chuyên môn, nghiệp vụ của Viện và ra các quyết định của viện trưởng theo thẩm quyền sau khi được chủ tịch viện phê chuẩn.
- Có quyền tuyển dụng lao động làm việc theo chế độ hợp đồng;
- Có quyền và nghĩa vụ khác theo quy định của pháp luật.
2.2.2. Các Phó Viện trưởng
- Các Phó Viện trưởng do chủ tịch Hội Bảo vệ Thiên nhiên và Môi trường Việt Nam bổ nhiệm, miễn nhiệm theo đề nghị của Hội đồng thành viên do Chủ tịch hội đồng thành viên ký đề nghị, có trách nhiệm giúp Viện trưởng trong việc lãnh đạo chung công tác của Viện, chịu trách nhiệm trước Viện trưởng, trước Hội đồng thành viên về phần công tác được phân công, được quyền quyết định những vấn đề thuộc phạm vi nhiệm vụ được giao;
- Trong trường hợp Viện trưởng vắng mặt, một Phó Viện trưởng được Viện trưởng ủy quyền thay mặt điều hành và giải quyết công việc của Viện và chịu trách nhiệm trước Viện trưởng, trước chủ tịch Hội Bảo vệ Thiên nhiên và Môi trường Việt Nam và trước Pháp luật trong thời gian được ủy quyền.
3. Nhân lực của Viện
3.1. Kế toán trưởng
Do Viện trưởng bổ nhiệm, miễn nhiệm trên cơ sở đã được chủ tịch thành viên viện phê chuẩn.
Nhiệm vụ và quyền hạn:
- Giúp Viện trưởng quản lý công tác tài chính – kế toán của Viện và chịu trách nhiệm trước Viện trưởng và trước pháp luật về lĩnh vực thu – chi tài chính theo đúng quy định của pháp luật.
3.2. Cán bộ, nhân viên
- Cán bộ, nhân viên của Viện bao gồm: cán bộ, nhân viên làm việc theo chế độ chính nhiệm, kiêm nhiệm và các cộng tác viên là các nhà khoa học có trình độ, có kinh nghiệm và được trả thù lao theo công việc tham gia thực hiện.
- Cán bộ, nhân viên làm việc tại Viện phải có ý thức trách nhiệm, tự giác, chịu trách nhiệm với công việc được giao; có nghiệp vụ chuyên môn, phải hoàn thành tốt các công việc được giao đúng thời hạn, có chất lượng do Viện phân công;
- Cán bộ, nhân viên được đảm bảo các quyền lợi, nghĩa vụ theo đúng pháp luật quy định;
- Việc tuyển dụng cán bộ, nhân viên làm việc tại Viện theo năng lực, tay nghề, ý thức trách nhiệm, có đầy đủ hồ sơ cá nhân theo quy định của Nhà nước.